Curriculum vitae for Søren W. Rasmussen
|
Personlige data
|
Fødselsdag
Ægteskabelig status
Børn
Adresse
Telefon
Email
Hjemmesider
Weblog
|
• 18. oktober, 1945
• Gift siden 1969 med grafisk designer Nina T. Rasmussen
Morten Wilken (Enterprise Architect)
Mette Fairgrieve (Webmaster, Forfatter)
• Skovstræde 22, Flintinge. DK-4891 Toreby L, Danmark
• +45 2197 2259
• swr@seqtools.dk
swr@swr.dk
• swr.dk (på dansk)
seqtools.dk (in english)
lollandfalster-links.dk (på dansk)
checkjobnet.dk (på dansk)
helles-klint.dk (på dansk)
www.krattet.dk (på dansk)
www.flintinge.dk (på dansk)
• www.lolland-falster.blogspot.com (på dansk)
|
Uddannelse
|
Studentereksamen
Uafsluttede studier
Cand. scient. (MSc)
Lic. scient.(PhD)
Dr. scient. (DSc)
|
• 1964 Ålborg Katedralskole, matematisk linie
• 1964 - 1965 Københavns Universitet. Matematik, fysik og kemi
• 1965 - 1973 Københavns Universitet. Biologi med
matematik, fysik og kemi. Hovedfag: Genetik
• 1974 Københavns Universitet. Genetik
• 1981 Københavns Universitet. Genetik
|
Beskæftigelse
|
Ufaglært arbejder
Studenterinstruktør
Senior scientist
Principal scientist
Ledig
IT-Konsulent
Efterløn
Pension
|
• 1964 - 1967 Ålborg Portland A/S. Periodevis ansættelse.
• 1969 - 1973 Københavns Universitet, Genetisk Institut.
• 1973 - 2002 Carlsberg Laboratorium.
Fysiologisk Afdeling.
Gærgenetisk Afdeling. Carlsberg Forskningscenters Biosektor.
• 2002 - 2004 H. Lundbeck A/S med ansvar for bioinformatik.
• 2004 - 2007 Ledig. Som led i jobsøgning opbygget webportalerne
www.Lolland-Falster Links.dk og
www.checkjobnet.dk.
• 2006 - Sønderskovhjemmet med ansvar for opbygning og drift af
den grafiske virksomhed SH-Grafik samt for opbygning og support
af pc netværk for hjemmets beboere.
• 2008 - Overgang til efterløn den 18. august 2008.
• 2010 - Overgang til pension den 18. oktober 2010.
|
Undervisning |
Kursusundervisning
Supervision
Undervisning
Foredrag
Populærvidenskab
Redaktionelt arbejde
|
• Planlægning af danske og internationale laboratoriekurser
ved Københavns Universitet og
European Molecular Biology Organisation (EMBO).
Kursusundervisning ved Kgl Veterinær- og Landbohøjskole,
Forskningscenter Flakkebjerg, Århus Universitet mf.
• Vejledning af speciale- og PhD studerende ved
Carlsberg Laboratorium og Københavns Universitet.
• Undervisning af 3g studerende (afsluttende opgave), studerende ved
laboranthøjskolen og folkeskolens 9. klasse praktik.
Kurser i grundlæggende pc anvendelse for pensionister.
• Inviteret taler ved et stort antal danske og
internationale kongresser, symposier og møder.
• Populærvidenskabelige foredrag i en række
forskellige sammenhænge.
• Teknisk redaktør af Carlsberg Research Communications.
Redaktør af en række specielle publikationer, blandt andet med
ansvar for indhold, layout og kommunikation med trykkeri.
|
Konsulentarbejde |
Bioinformatik
|
• Konsulent i bioinformatik ved laboratorier i Danmark, Frankrig,
England, Tyskland, Østrig, Australien og USA.
|
Censurering |
Københavns Universitet
|
• 1993 - 2002 Censor ved Københavns Universitet.
Førstedelskursus i genetik samt hovedfagseksaminer ved
Københavns Universitet og Laboranthøjskolen.
|
Patenter |
Ultrostainer
|
• Opfundet og udviklet
An automatic apparatus for double staining....
Apparatet markedsført af LKB/Pharmacia og er patenteret
i mit navn i Sverige, USA, Tyskland, Frankrig, Østrig og Japan.
|
Forretningsplan |
Bioethanol
|
• Sammen med fire medarbejdere fra Carlsberg Laboratorium og
konsulentfirmaet McKinsey & Company udarbejdet forretningsplan
for produktion af bioethanol til motorbrændstof ved hjælp af
genmodificerede gærstammer.
|
Softwareudvikling |
Kvantitativ EM analyse
Sekvensanalyse I
Sekvensanalyse II
CMS software
Håndtering af web Farver
Registrering af aktiv jobsøgning
Databaseprogram til personregistrering
Håndtering af billedfiler m.v.
|
• 1980 - 1987 Programpakke til analyse af 3D rekonstructioner af
meiotiske kromosomer baseret på elektronmikrografier.
• 1995 - 2002 Softwarepakken, DNATools, til håndtering og analyse af
nucleotid- og proteinsekvenser med ca. 50.000 besøg på
hjemmesiden i perioden 1998 til 2002 og ca. 800 registrerede brugere.
• 2002 - Softwarepakken, SEQtools 8.4, til håndtering og analyse af
nucleotid- og proteinsekvenser. Ca. 26.000 downloads siden 2002 og
ca. 5.000 registrerede brugere verden over.
• CMS software til håndtering af linkdata for
webportalen Lolland-Falster Links.
• 2006 - Programmet, ColorMate 5.01, til håndtering af farver
ved udvikling af websites.
• 2007 - 2009 Programmet, CheckJobnet 7.5 til automatisk besøg
på www.jobnet.dk. 111.464 besøg på websitet for programmet
per januar 2016. Programmet vedligeholdes ikke i dag.
• 2009 - 2011 Programmet, Small Database Utility 8.0 til
håndtering af personoplysninger, blandt andet på
forsorgshjemmet, Sønderskovhjemmet.
• 2012 - 2022 Programmet, File & Folder Tools 22.x.x til
håndtering af billedfiler, opbygning af javabaseret billedviser, etc
|
IT kvalifikationer |
Undervisning
Support
Datasikkerhed
Softwarekendskab
Internet
Grafisk afdeling
Computernetværk
|
• IT ansvarlig for Fysiologisk afdeling, Carlsberg Laboratorium,
herunder undervisning af medarbejdere og studenter samt indkøb
og vedligeholdelse af PC udstyr.
• Software support for medarbejdere, Molecular Genetics,
H. Lundbeck A/S.
• Medlem af datasikkerhedsudvalg på
De Forenede Bryggerier i flere år.
• Indgående kendskab til en lang række softwareprodukter,
blandt andet Microsoft og Adobes produkter, Lasergene, VectorNTI,
Windows OS.
• Rutineret bruger af internetfaciliteter, herunder
datasøgning og analyse på en lang række dedikerede
udenlandske servere (eg NCBI , Emsembl, mf.).
• Opbygget grafisk afdeling for produktion af bøger, tryksager samt
internetbaserede publikationer.
• Vedligeholdelse og drift af serverbaseret pc-facilitet for beboere på
Sønderskovhjemmet.
|
Informationsformidling |
Mundtlig
Skriftlig
Internet
Hjemmesider
Digital fotografering
Fotoudstilling
|
• Avancerede powerpoint præsentationer til undervisning og foredrag
herunder fremstilling af kompliceret grafik og animerede forløb.
Bearbejdning af komplicerede problemstillinger indenfor en række
emneområder til enkle, forståelige præsentationer.
• Bearbejdning af omfattende, uoverskuelig information med henblik
på fremstilling af forståeligt skriftligt materiale
(videnskabelige artikler, avisartikler, brugermanualer,
breve til offentlige myndigheder, forsikringsselskaber)
for forskellige målgrupper.
• Opbygning af komplette webportaler/hjemmesider herunder
fremstilling, indsamling og bearbejdning af tekst,
billedmateriale og grafik.
• Erfaring i html-, javascript- og php-kodning.
Se for eksempel hjemmesiderne for:
forsorgshjemmet Sønderskovhjemmet
sommerhusområdet Helles Klint
kunstgalleriet Galleri-Schlegel
psykolog Bente Schiele
hundekennelen von Barnewitz
portalen Checkjobnet for ledige
turismeportalen Lolland-Falster Links for turister m.f.
For alle hjemmesiderne medvirket som både tekstforfatter og
informationsansvarlig.
• Rutineret fotograf (anvender Panasonic FZ150 og
Nikon D7100).
Inden- og udendørs fotografering med efterfølgende
bearbejdning af billedmateriale for tryk og publikation på Internet.
• Fotoudstilling maj 2013 på Galleri Schlegel
|
Socialt engagement |
Aflastningsfamilie
Skolearbejde
Assistance til ledige
|
• 1996 - 2001 Formidlet døgnophold for socialt vanskeligt stillet pige,
Socialcenteret Blågård, København N underAflastningsfamilieordningen
(NB linket er ikke til Socialcenteret Blågård,
men beskriver ordningen i korte træk)
• 1985 - 1989 Medlem af bestyrelse for Frederik Barfods Skole.
Var initiativtager til indførelse af EDB i undervisningen.
• Konsulentbistand til ledige i Danmark, herunder udvikling af
softwareunderstøttelse til registrering og jobsøgning på www.jobnet.dk.
|
Samfundsdebat |
Om behandling af arbejdsløse
Turisme på Lolland-Falster
|
• 2007 - 2008 Deltager i debatten om det offentliges krav til ledige
med offentliggørelse af programmet CheckJobnet som
automatisk opfylder Arbejdsmarkedsstyrelsens krav til ledige for
udbetaling af dagpenge og kontanthjælp.
111.464 besøg på hjemmesiden,
omtale i radioavisen samt i en række andre medier.
• Webportalen Lolland-Falster Links
samt webloggen En tilflytter på Lolland-Falster
med debat om turisme mm. på Lolland-Falster.
|
Værnepligt |
Civilforsvarstjeneste
|
• 1975 - 1975 Otte måneders værnepligt ved Hillerød CF kaserne.
Udvidet førstehjælpskursus samt certifikat som røgdykker.
|
Private interesser |
Musik
Have
Håndværk
Skovarbejde
Trædrejning
|
• Passioneret samler af jazz og blues musik.
• Førstepris i Bo Bedre konkurrence
om landets smukkeste haver, august 2001, p50
• Bygningsrestaurering. Istandsat en af de ældste bevarede villaer i Valby.
Rutineret mekaniker.
• Noget mindre rutineret skovarbejder, men arbejder energisk på sagen.
• Anskaffede i efteråret 2013 en trædrejebænk for at genoptage min
ungdoms fritidsbeskæftigelse. Du kan læse mere om
dette projekt på Trædrejeren i Krattet.
|
Publikationer |
Publikationer
Reviews
|
• 101 publikationer siden 1973 i internationale tidsskrifter, bøger
og på Internettet. Se min publikationsliste.
• Du kan finde henvisninger til mit videnskabelige arbejde
ved at at kikke på denne
Google søgning
og på websitet Meiosis, Recommended papers.
|
Videnskabelige aktiviteter (in english)
|
Brief review of major scientific activities:
Worked for about 15 years with Preben Bach Holm unraveling the ultrastructural mysteries of meiosis in a number of organisms from fungi to man. Developed advanced methods for
serial section and 3D reconstruction analyses of the behaviour of homologous chromosomes during the entire meiotic division. Headed one of the most successful goups in this field and gave a
large number of lectures at international congresses and meetings around the world. Stayed for two months at the National Academy of Science in Moscow.
For more than ten years, I have been heading the sequencing laboratory at the Carlsberg Research Center. During this period we have participated in the European Yeast
sequencing network as one of the ten most efficient participants in the network, leading to completion of the full nucleotide sequence of the yeast genome in 1996.
Subsequently, we initiated a combined expressed sequence tag (EST) and
serial analysis of gene expression (SAGE) analysis of gene expression during the infection process of the pathogenic fungus, Blumeria graminis, a serious pathogen in barley.
During this work, the manual handling and analysis of the large amounts of nucleotide sequences rapidly exceeded the capacity of the group.
As a consequence, a series of software routines were developed to automate data handling and analysis and to improve data accessibility for the members of the research team.
The routines were merged into the comprehensive sequence analysis package, dnatools, in 2002 continued as Seqtools. This software package is used by research groups all over the world for
handling, data retrieval and automated sequence analysis, including database searching via client/server connection to National Center for Biotechnological Information, NCBI.
A list of functions included in the package can be found under the "manual" index item on the seqtools homepage, at
www.seqtools.dk.
In 2002 - 2004 software routines were added to seqtools for design of microarray expression analyses of putative candidates for drug development in the Danish medical company,
H. Lundbeck A/S. The program is still (2017) available for downloading and is to some extent also maintained.
Since 2004 without formal emploiment, but engaged in various activities
related to building a local network with the aim of creating a job opening in the Lolland-Falster region of Denmark. As part of this work created a webportal,
Lolland-Falster Links, including the vast majority of websites describing the region. Founded the grafical company SH-Grafik, Developed several
software solutions to support these activities.
Active in public debate regarding government activities to reduce unemploiment in Denmark. Wrote the computer program
Checkjobnet (visitors at website as of today: 111.474) to demonstrate the inadequate measures taken by the administration.
The Checkjobnet played a major rôle in the subsequent change in handling of unemploied in Denmark. In 2009 the minister of emploiment was relieved from his duties at the ministery.
In recent years I have - among other things - been self emploied as a woodturner producing quite nice woodden bowls from the trees groving
around our house in Krattet, Lolland.
Updated on July 3th 2022
|